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醉染图书计算生物学导论——图谱、序列和基因组9787030251565
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《生物数学丛书》序
前言
数学符号
第0章 引言
0.1 分子生物学
0.2 数学,统计和计算机科学
章 分子生物学一些知识
1.1 DNA和蛋白
1.1.1 双螺旋结构
1.2 中心定理
1.3 遗传密码
1.4 转化RNA和蛋白序列
1.5 基因不简单
1.5.1 开始与停止
1.5.2 基因表达的控制
1.5.3 割裂基因
1.5.4 跳跃基因
1.6 生物化学
问题
第2章 图谱
2.1 引言
2.2 图
. 区间图
2.4 片段大小的度量
问题
第3章 多重图谱
3.1 双消化问题
3.1.1 双消化问题的多重解
3.2 多重解分类
3.2.1 反
3.2.2 重叠等价
3.. 重叠尺寸等价
3.2.4 更多的图论知识
3.2.5 从一条路到另一条路
3.2.6 图谱及边界块图
3.2.7 图谱的盒变换
3.2.8 一个例子
问题
第4章 求解DDP的算法
4.1 算法和复杂
4.2 DDP是NP接近的
4.3 解DDP的方法
4.3.1 整数规划
4.3.2 划分问题
4.3.3 TSP
4.4 模拟退火法:TSP和DDP
4.4.1 模拟退火法
4.4.2 TSP
4.4.3 DDP
4.4.4 环状图谱
4.5 用真实数据作图
4.5.1 使数据符合图
4.5.2 图谱算法
问题
第5章 克隆与克隆文库
5.1 有限的随机克隆数
5.2 接近消化的文库
5.3 部分消化的文库
5.3.1 可克隆基的组分
5.3.2 采样、方法1
5.3.3 设计部分消化文库
5.3.4 Poisson近似
5.3.5 获得所有片段
5.3.6 优选表达度
5.4 每个微生物中的基因组
……
第6章 物理基因组图谱:海洋、岛屿和锚
第7章 序列装配
第8章 数据库和快速序列装配
第9章 动态规划、两个序列比对
0章 多重序列比对
1章 序列比对用到的概率和统计
2章 有关序列模式的概率与统计
3章 RNA二级结构
4章 树和序列
5章 来源与展望
参考文献
附录 问题解答和提示
索引
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