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  • 醉染图书生命科学家的Python指南9787030665980
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    • 作者: (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特著 | (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特编 | (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特译 | (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特绘
    • 出版社: 科学出版社
    • 出版时间:2020-10-01
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    • 作者: (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特著| (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特编| (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特译| (美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特绘
    • 出版社:科学出版社
    • 出版时间:2020-10-01
    • 版次:1
    • 印次:1
    • 字数:390600
    • 页数:312
    • 开本:16开
    • ISBN:9787030665980
    • 版权提供:科学出版社
    • 作者:(美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特
    • 著:(美)亚历山大·兰卡斯特,(美)戈登·韦伯斯特
    • 装帧:平装
    • 印次:1
    • 定价:180.00
    • ISBN:9787030665980
    • 出版社:科学出版社
    • 开本:16开
    • 印刷时间:暂无
    • 语种:暂无
    • 出版时间:2020-10-01
    • 页数:312
    • 外部编号:1202189988
    • 版次:1
    • 成品尺寸:暂无

    绪论:欢迎来到尼迪亚王国

    章Python入门:设置及使用Python

    1.1在计算机上安装Python

    1.2为您的计算机下载Python的近期新版

    1.3在macOS计算机上安装Python

    1.4在Linux计算机上安装Python

    1.5在Windows计算机上安装Python

    1.6使用LE的Python界面

    1.7Python开发环境

    1.8安装Python套件管理程序pip

    1.9获取示例代码

    1.10参考资料和进一步阅读

    第2章实验台上的Python:Python语言基础

    2.1在Python中声明变量

    2.2用Python处理所有的数据类型

    .个真正的Python代码

    2.4Python函数

    2.5在Python中使用整数和小数

    2.6条件语句

    2.7参考资料和进一步阅读

    第3章理解序列:生物序列和Python的数据结构

    3.1序列与字符串

    3.2列表及

    3.3方法与对象

    3.4您的朋友——Python字典

    3.5用Python实现DNA酶的内切功能

    3.6参考资料和进一步阅读

    第4章统计插值:贝叶斯定理与生物标记物

    4.1贝叶斯及其有名定理

    4.2贝叶斯定理的应用:生物标记物的能

    4.3贝叶斯定理的数学解析

    4.4用Python实现贝叶斯生物标记物函数

    4.5用通用贝叶斯函数进行字符串格式化

    4.6参考资料和进一步阅读

    第5章打开数据之门:读取、解析和处理生物数据文件

    5.1用Python打开文件

    5.2更改变量类型

    5.3出错处理:Python的异常处理

    5.4重新开始:解析FASTA文件

    5.5参考资料和进一步阅读

    第6章生物序列的搜索:基因组和序列的正则表达式

    6.1Python的正则表达式库及导入

    6.2用正则表达式识别基因启动子

    6.3MatcObec:个真实的Python对象

    6.4Python用于真正的基因组学时太慢了?
    6.5参考资料和进一步阅读

    第7章对象课程:生物序列作为Python的对象

    7.1为什么要进行面向对象的编程?

    7.2程序的组织——OOP

    7.3生物序列处理的OOP实现

    7.4命名空间和模块

    7.5类定义的结构

    7.6类的继承

    7.7类变量、实例变量和作为变量的类

    7.8有关继承和覆盖继承方法的进一步讨论

    7.9参考资料和进一步阅读

    第8章基因组数据的切片和分块:下一代测序流程

    8.1下一代基因测序:从FASTA到FAST

    8.2调用子流程

    8.3pySam:用Python读取比对文件

    8.4测序读段的可视化

    8.5测序读段的

    8.6建立命令行工具

    8.7流程:将所有内容放在一起

    8.8下一步的工作

    8.9参考资料和进一步阅读

    第9章孔板:微量滴定板分析I——数据结构

    9.1机器人

    9.296孔板简介

    9.3用Python类实现多孔板

    9.4孔板的遍历

    9.5分配和检索孔板的数据

    9.6读取和写入CSV文件

    9.7孔板中的数学

    9.8参考资料和进一步阅读

    0章孔板的进一步探讨:微量滴定板分析Ⅱ——自动化和可视化

    10.1孔板的物理映

    10.2在孔板上移动的编程

    10.3用matplotlib可视化多孔板

    10.4用matplotlib制作色图

    10.5matplotlib的绘图命令

    10.6不同孔板的布局

    10.7参考资料和进一步阅读

    1章分子的3D表示:结构生物学的数学和线代数

    11.1分子键的旋转

    11.2分子力学和分子动力学

    11.3自己动手去体会程序的运行效率

    11.4输入3D数学矩阵

    11.5分子系统的Python表示

    11.6用matplotlib进行3D可视化

    11.7程序测试

    11.8计算静电相互作用

    11.9参考资料和进一步阅读

    2章打开和关闭基因:用matplotlib可视化生化动力学

    12.1简单的转录抑制:乳糖操纵子

    12.2NumPy及From...Import简介

    1.双重交互阻遏物:更高效的抑制

    12.4相同的浓度、更强的抑制:注释图

    12.5参考资料和进一步阅读

    3章梳理网络伪信息:用Python集合挖掘系统生物学数据

    13.1用集合制作表格

    13.2双字典结构:网络的数据结构

    13.3列表推导式

    13.4基因调控问题

    13.5汇总:使用Python的__main__

    13.6参考资料和进一步阅读

    4章遗传反馈循环:用Gillespie算法为基因网络建模

    14.1二聚体

    14.2动态过程

    14.3噪声的引入

    14.4实际的操作:拨动开关

    14.5三合一:开启基因

    14.6所有蛋白质消亡

    14.7生物化学的Python代码

    14.8记录参与反应的分子

    14.9生物分子的模拟

    14.10随机切换问题

    14.11参考资料和进一步阅读

    5章种植虚拟花园:用L系统模拟植物生长

    15.1增加繁殖率:算法生成规则

    15.2用Python的Turtle图形生长蕨类植物

    15.3参考资料和进一步阅读

    6章细胞自动机:图灵模式的细胞自动机模型

    16.1细胞自动机初始化

    16.2创建更新规则

    16.3生成细胞自动机涂层图案

    16.4形态生成的显示

    16.5参考资料和进一步阅读

    ……

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