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  • 醉染图书生物信息学9787308171472
  • 正版全新
    • 作者: 樊龙江 主编著 | 樊龙江 主编编 | 樊龙江 主编译 | 樊龙江 主编绘
    • 出版社: 浙江大学出版社有限责任公司
    • 出版时间:2017-09-01
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    • 作者: 樊龙江 主编著| 樊龙江 主编编| 樊龙江 主编译| 樊龙江 主编绘
    • 出版社:浙江大学出版社有限责任公司
    • 出版时间:2017-09-01
    • 版次:1
    • 印次:1
    • 字数:830000
    • 页数:517
    • 开本:16开
    • ISBN:9787308171472
    • 版权提供:浙江大学出版社有限责任公司
    • 作者:樊龙江 主编
    • 著:樊龙江 主编
    • 装帧:平装
    • 印次:1
    • 定价:98.00
    • ISBN:9787308171472
    • 出版社:浙江大学出版社
    • 开本:16开
    • 印刷时间:暂无
    • 语种:暂无
    • 出版时间:2017-09-01
    • 页数:517
    • 外部编号:1201588956
    • 版次:1
    • 成品尺寸:暂无

    绪论
    节生物信息与生物信息学
    一、迅速增长的生物信息
    二、生物信息学的概念
    第二节生物信息学简史与展望
    一、生物信息学发展简史
    二、生物信息学技术的应用
    三、生物信息学学科展望
    第三节本书的组织与使用
    篇生物信息学基础
    -1章生物信息类型及其产生途径
    节生物信息的类型
    第二节DNA测序技术
    一、代测序技术
    二、第二代测序技术
    三、第三代测序技术
    第三节高通量测序技术的应用
    一、DNA/RNA相关测序
    二、蛋白质-DNA/RNA互作测序
    三、甲基化/宏基因组测序
    第四节蛋白质序列及其结构测定
    一、蛋白质序列与蛋白质互作测定
    二、蛋白质结构测定
    -2章分子数据库
    节子数据库概述
    一、分子数据库概念
    二、数据库记录格式
    三、数据库冗余、序列递交和检索
    第二节核苷酸及其相关数据库
    一、DNA/RNA序列数据库
    二、基因组数据库
    三、非编码RNA数据库
    第三节蛋白质及其相关数据库
    第四节代谢途径等专业数据库
    一、代谢途径数据库
    二、代谢组学数据库和表型数据库
    -3章两条序列联配算法及序列搜索
    节序列联配基本概念
    第二节计分矩阵
    一、计分矩阵的一般原理
    二、氨基酸替换矩阵
    三、位置特异计分矩阵(PSSM)
    第三节两条序列联配算法
    一、Needleman-Wunsch算法
    二、Smith-Waterman算法
    第四节BLAST算法及数据库搜索
    一、BLAST算法
    二、利用BLAST进行数据库序列搜索
    三、序列相似的统计推断
    -4章多条序列联配算法及功能域分析
    节多序列联配概念及其算法
    一、多序列联配概念
    二、多序列全局联配算法
    三、多序列局部联配算法
    第二节蛋白质序列功能域分析与模型
    一、功能域概念
    二、功能域模型
    第三节熵与信息量
    一、不确定与信量
    二、信息熵的应用
    -5章基因预测与功能注释
    节基因组序列构成与基因预测
    一、基因组序列的基本构成
    二、基因预测及其基本方法
    三、基因注释流程
    第二节从头预测--隐马尔可夫模型(HMM)方法
    一、马尔可夫和隐马尔可夫模型
    二、隐马尔可夫模型问题及其算法
    三、HMM基因预测模型及其应用
    第三节贝叶斯统计及其在基因预测方面的应用
    一、贝叶斯统计与生物信息学
    二、利用贝叶斯统计进行基因预测
    第四节基因功能注释
    一、利用序列和结构域数据库进行注释
    二、利用功能分类和代谢途径信息进行注释
    第五节基因序列构成分析
    一、碱基构成与分布
    二、DNA行走与Z曲线
    三、同向重复序列分析
    四、蛋白质序列跨膜等特征分析
    -6章系统发生树构建
    节系统发生树与遗传模型
    一、系统发生树概述
    二、遗传模型
    第二节距离法
    一、非加权平均连接聚类法(UPGMA法)
    二、Fitch-Margoliash算法
    三、邻接法(NJ法)
    第三节简约法
    第四节似然法
    一、DNA序列的似然模型
    二、两条序列系统发生树
    三、三条及多条序列系统发生树
    第五节基因组组分矢量方法
    一、组分矢量方法(CVTree算法)
    二、基因组关联“距离”与系统发生树构建
    -7章蛋白质结构预测与药物设计
    节蛋白质结构概述
    一、蛋白质结构及其预测
    二、蛋白质结构数据库
    三、蛋白质结构主要预测工具
    第二节蛋白质二级结构预测
    一、蛋白质二级结构预测方法
    二、结构预测实例
    第三节蛋白质三级结构预测
    一、同源建模法
    二、折叠识别法
    第四节计算机辅药物设计
    一、间接药物设计
    二、直接药物设计
    -8章生物信息学计算机基础
    节使用Unix/Linux操作系统
    一、Unix/Linux操作系统及其结构
    二、LinuxShell常用命令
    第二节掌握一门计算机编程语言
    一、计算机编程语言
    二、Python语言
    三、R语言
    四、MySL语言
    第三节并行与自动化
    一、并行式计算
    二、并行化模型及其实例
    第四节
    一、算法
    二、可视化与画图
    始第二篇高通量测序数据分析
    2-章基因组拼接与分析
    节基因组序列拼接概念
    一、基因组短序列拼接问题
    二、基因组从头拼接主要方法
    三、利用遗传图谱等进行基因组纽装
    第二节基于图论的拼接算法
    一、图论
    二、基于德布鲁因图的拼接算法
    第三节第三代测序数据拼接方法
    第四节基于字符串(K-mer)的基因组调查与分析
    一、基因组大小估计
    二、基因组复杂度估计
    三、基因组“肖像”及缺失字符串分析
    第2-2章基因组变异与分析
    节基因组变异类型与检测方法
    一、基因组遗传变异类型
    二、基因组变异检测方法
    第二节基因组重测序及其应用
    一、基因组重测序应用领域
    二、基因组重测序数据分析
    第-章转录组分析
    节转录组测序与拼接
    一、转录组及其技术平台
    二、转录组序列拼接
    第二节基因表达分析
    一、差异表达基因的鉴定
    二、差异表达基因富集分析
    第三节可变剪切和基因融合分析
    一、基因可变剪切
    二、融合基因
    第2-4章非编码RNA分析
    节非编码RNA简介
    一、非编码RNA类型与功能
    二、非编码RNA进化
    三、样品采集及其测序方法
    四、非编码RNA主要数据库
    第二节小RNA计算识别与靶基因预测
    一、miRNA主要特征及计算识别
    二、siRNA主要特征及计算识别
    三、miRNA和siRNA靶基因预测
    第三节长非编码RNA鉴定与功能分析
    一、线IncRNA鉴定
    二、环化RNA鉴定
    三、IncRNA功能预测
    第2-5章甲基化与组蛋白修饰分析
    节表观遗传机制概述
    第二节甲基化测序与分析
    一、甲基化测序原理
    二、生物信息学分析方法
    第三节组蛋白修饰测定与分析
    一、组蛋白样品的制备
    二、组蛋白修饰分析方法
    第2-6章宏基因组分析
    节宏基因组及其分析方法
    一、宏基因组概述
    二、宏基因组学技术的应用
    第二节16SrDNA序列分析
    一、质控与分析流程
    二、物种多样分析
    三、群落结构分析
    第三节全基因组序列数据分析
    一、分析内容与流程
    二、基因预测及功能注释
    第2-7章蛋白质组分析
    节蛋白质组学概述
    一、蛋白质组及其分析
    二、高通量分离和鉴定技术
    第二节双向电泳图像与质谱组合分析
    一、胶图获取与分析
    二、利用指纹图谱鉴定蛋白质
    第三节质谱数据采集与分析
    一、质谱数据采集策略
    二、肽段数据库搜索与质量控制
    第四节定量蛋白质组分析
    一、同位素标记定量分析
    二、非同位素标记定量分析
    ……
    第三篇生物信息学外延与交第四篇生物信息学资源与实践
    参考文献

    樊龙江,浙江大学生物信息学研究所和作物科学研究所教授,生物信息学和作物遗传育种专业博士生导师。“世纪很好人才支持计划”获得者,浙江省生物信息学学会副理事长,德国DAAD访问学者。自2000年起,直接参与浙江大学生物信息学学科筹建,为浙江大学靠前批生物信息学专业导师。

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