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全新正版资源转录组分析操作指南9787547830130上海科技
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篇 理论篇 一、资源转录组概述 (一)转录组的研究目标 (二)转录组的研究方法 (三)资源转录组研究现状 (四)资源转录组研究展望 二、同源基因功能分化与活成分变异机制 (一)同源基因的正确注释是研究药用植物活成分 变异的重要前提 (二)重复基因的功能分化是形成药用植物活成分 变异的基础 (三)药用植物基因功能分化决定其活成分的变异 三、功能EST—SSR标记 (一)功能EST~SSR的基本概念 (二)功能EST—SSR的开发流程 (三)功能EST—SSR的优势 (四)功能EST—SSR标记在资源中的应用 (五)药用植物功能EST—SSR标记展望第二篇 技术篇 一、转录组数据的组装 实验一样品收集与保存 实验二RNA提取 实验三mRNA分离纯化 实验四Solexa文库制备 实五上测序 实验六转录组数据组装 实验七转录组数据功能注释 二、基因克隆及表达分析 实验八基因克隆 实验九基因表达分析 实验十共表达分析 三、数据库使用及生物信息学分析 实验十一核酸数据库及其使用 实验十二蛋白质数据库及其使用 实验十三代谢数据库及其使用 实验十四文献数据库及其使用 实验十五NCBI序列数据的提交 实验十六多序列对位排列分析 实验十七系统发育分析 实验十八核酸序列的分析和转换 实验十九基因开放阅读框预测 实验二十蛋白质理化质预测 实验二十一蛋白质亚细胞定位信号预测 实验二十二蛋白质信号肽和跨膜结构域预测 实验二十三蛋白质二级结构和三级结构预测 四、SSR标记开发 实验二十四SSR位点开发 实验二十五SSR引物设计 实验二十六基因组DNA提取 实验二十七琼脂糖凝胶电泳 实验二十八非变聚丙烯酰胺凝胶电泳 实验二十九SSR数据统计 实验三十SSR数据分析第三篇 实践篇 一、金银花转录组与质量评价标记筛选 二、地黄根部转录组文库的构建及响应连作障碍关键基因的筛选 三、比较转录组学和代谢组学相结合研究丹参酮生物合成分子机制 四、罗汉果果实转录组测序的研究 五、基于转录组测序揭示适度干旱胁迫对甘草根基因表达的调控 六、基于黄芩cDNA文库的功能EST—SSR标记开发 七、茯苓转录组SSR序列特征及其功能预测 八、川西獐牙菜(藏茵陈)转录组SSR信息分析 九、厚朴MVA途径相关基因鉴定及生物信息学分析 十、三七香叶基香叶基焦磷酸合酶基因的克隆及表达分析
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