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  • 正版新书]DNA微阵列实验指南D.鲍特尔9787030172990
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    • 作者: D.鲍特尔著 | D.鲍特尔编 | D.鲍特尔译 | D.鲍特尔绘
    • 出版社: 科学出版社
    • 出版时间:2008-02-01
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    • 作者: D.鲍特尔著| D.鲍特尔编| D.鲍特尔译| D.鲍特尔绘
    • 出版社:科学出版社
    • 出版时间:2008-02-01
    • 版次:0
    • 印次:0
    • 印刷时间:2008-01-29
    • 开本:16开
    • ISBN:9787030172990
    • 版权提供:科学出版社
    • 作者:D.鲍特尔
    • 著:D.鲍特尔
    • 装帧:精装
    • 印次:0
    • 定价:118
    • ISBN:9787030172990
    • 出版社:科学出版社
    • 开本:16开
    • 印刷时间:2008-01-29
    • 语种:暂无
    • 出版时间:2008-02-01
    • 页数:0
    • 外部编号:涿仝西I3258
    • 版次:0
    • 成品尺寸:暂无

        译者序
    原著序
    前言
    原著作者名单
    章 点样微阵列探针的生成
    导言
    方案
    1.cDNA克隆集的复制和储存
    ?附加方案:使用冷冻菌种
    2.来自细菌克隆集探针的PCR扩增
    ?可选方案:作为扩增模板的质粒DNA的制备
    3.PCR产物的纯化
    ?可选方案:用乙醇沉淀法纯化扩增产物
    4.PCR产物的观察和评估
    ?附加方案:用PicoGreen进行定量
    5.点样法阵列备用DNA的重新悬浮及储存
    6.从酵母中分离和扩增用于阵列的材料
    信息栏
    克隆集
    点样微阵列中使用的对照
    基因组和cDNA文库中T1噬菌体的预防和检测
    长链寡核苷酸的点样:替代用于表达分析的cDNA阵列
    酵母探针
    参考文献
    因特网资源

    第2章 玻璃微阵列的点样
    导言
    方案
    1.制备用于微阵列的聚L-赖氨酸玻片
    2.在玻片上点样
    3.检查印刷玻片的质量
    ?替代方案:利用标记的引物杂交
    4.鹅毛笔针的保养与清洗
    信息栏
    微阵列接触印刷使用的点样仪与点样针
    用于点样的基底
    参考文献
    因特网资源

    第3章 RNA的表达分析
    导言
    PART Ⅰ RNA分离
    导言
    方案
    1.来自哺乳动物组织和细胞的总RNA的纯化
    ?替代方案:从OCT包埋的病理样品中提取RNA
    2.用FastPrep仪器从组织中分离总RNA
    3.用TRIzol从植物组织中分离总RNA
    4.松树方法分离植物RNA

    5.用FastTrack分离poly(A)+RNA
    6.分离膜结合的多核糖体RNA
    7.用批量制备色谱法分离poly(A)+RNA
    8.用CsCl溶液超速离心分离RNA
    9.酵母总RNA的纯化
    ?替代方案:用锁相胶纯化RNA
    10.E.coli RNA的纯化
    11.从单细胞和少量组织中分离和扩增RNA
    ?替代方案:组织切片中RNA的原位转录
    ?附加方案:切片的吖啶橙染色
    12.RNA通用参考集
    PART Ⅱ 标记和杂交
    导言
    方案
    13.用反转录酶进行cDNA链的荧光标记
    ?替代方案:荧光标记的cDNA的纯化和浓缩(Microcon YM-30)
    14.用氨基烯丙基染料对DNA进行间接荧光标记
    15.用于为筛选DNA微阵列筛选产生靶序列的mRNA制备物的扩增
    ?附加方案:标记aRNA
    16.用于表达分析的少量mRNA的扩增
    17.用E.coli DNA聚合酶的Klenow片段标记第二链DNA
    ?替代方案:用E.coli DNA聚合酶的Klenow片段标记基因组DNA
    18.用生物素化核苷标记扩增RNA来与寡核苷酸阵列杂交
    ?附加方案:生物素化cRN的段化
    19.未掺入的Cy染料的回收:使用HPLC重新纯化
    20.杂交和杂交后洗涤
    ?附加方案:微阵列玻片的叠放
    疑难解答指南
    信息栏
    Alexa染料
    细菌微阵列
    用酚抽提蛋白质和DNA
    甲酰胺
    采用胍盐抽提RNA
    动物细胞及组织的匀浆
    抑制RNase
    哺乳动物、植物和细菌的RNA
    测量DNA染料标记的效率
    鼠白血病病毒反转录酶
    oligo-(dT)纤维素
    RNA的定量
    RNA操作的特别注意事项
    RNA的保存和回收
    参考文献
    因特网资源

    第4章 膜点样cDNA阵列
    导言
    PART Ⅰ 膜阵列的制备和杂交
    方案

    1.膜阵列的点样
    2.RNA的制备和标记
    3.靶分子与膜阵列的杂交
    ?附加方案:靶分子的清除和膜的重新利用
    PARTⅡ 数据的分析和解释
    参考文献
    因特网资源

    第5章 组织显微切割
    导言
    PART Ⅰ 徒手显微切割和激光俘获显微切割
    导言
    方案
    1.徒手显微切割
    ?替代方案:冰冻组织样品的显微切割
    2.激光俘获显微切割
    3.免疫-LCM
    4.应用于表达分析的显微切割组织的处理
    PART Ⅱ 激光压力弹
    导言
    方案
    5.准备载玻片用于为LMPC进行组织切片
    6.用于LMPC的石蜡包埋组织切片的制备
    7.用于LMPC的新鲜冰冻组织切片的制备
    8.使用Zincfix固定组织的LPC用于mRNA谱分析
    9.使用液体盖玻片保护组织样品
    10.激光显微切割和弹后活细胞的分离
    参考文献
    因特网资源

    第6章 基因组微阵列分析
    导言
    PART Ⅰ 微阵列检测DNA拷贝数
    导言
    方案
    1.cDNA微阵列比较基因组杂交
    2.制备BAC DNA用于通过连接介导PCR进行CGH
    3.BAC 基因组微阵列CGH
    4.基于微阵列的DNA拷贝数代表分析:靶DNA制备
    5.基于微阵列的DNA拷贝数代表分析:玻片制备及杂交
    PART Ⅱ 突变检测及SNP基因分型
    导言
    方案
    6.SBE-标签阵列用于SNP基因分型
    ?替代方案:为SBE进行多重扩增反应
    7.Affymetrix标签阵列用于SBE SNP基因分型
    8.高密度微阵列用于序列变异检测
    9.SNP阵列用于杂合缺失分析
    PART Ⅲ 基于微阵列的DNA-蛋白质相互作用检测:微阵列上的染色质免疫沉淀
    导言

    方案
    10.应用阵列对酵母基因组上DNA-蛋白质相互作用作图
    11.酵母基因组的DNA-蛋白质相互作用作图:DNA扩增及标记
    PART Ⅳ SNP序列:作图数据
    ?表6-7 多重引物集合:SNP作图数据
    ?表6-8 Affymetrix HuSNP芯片中的SNP在图谱上的位置
    参考文献
    因特网资源

    第7章 基因芯片生物信息学简介
    导言
    PART Ⅰ 微阵列表达实验的设计
    PART Ⅱ 图像分析
    PART Ⅲ 标准化
    PART Ⅳ 芯片数据的表示和评价
    PART Ⅴ LIMS、数据库和数据管理
    PART Ⅵ 聚类分析与显示
    PART Ⅶ 多维尺度法和自组织图
    信息栏
    基因注释
    在研究人员之间共享微阵列数据
    参考文献
    因特网资源

    第8章 组织微阵列
    导言
    方案
    1.制备组织微阵列
    ?附加方案:手工制备组织阵列
    2.应用组织阵列进行原位杂交
    3.组织阵列上的免疫组织化学
    ?替代方案:抗原去隐蔽和胰蛋白酶消化
    参考文献
    因特网资源

    附录
    附录1 构建全长基因文库
    附录2 试剂、缓冲液和培养基
    附录3 注意事项
    附录4 供应商
    DNA微阵列
    中文版索引
    原著索引
    图版

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