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正版 分子生态学与数据分析基础 王峥峰 科学出版社 978703046478
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前言
部分分子生态学理论
章分子生态与遗传变异
节遗传变异的产生
第二节分子标记的种类
第三节遗传变异的衡量
第四节遗传变异的维持、丧失
第二章分子生态学研究内容
节个体与物种区分、鉴定(差异与多样性)
第二节基因流和适应
第三节小种群
第二部分分子生态数据获得与分析——以微卫星体分子标记为例
第三章分子遗传标记的获得——微卫星体
节微卫星体获得:MsatCommander、inGAP、MicroFamily和GelQuest软件
第二节微卫星体数据初步整理分析:GenAIEx软件及其遗传多样性大小衡量
第四章遗传变异状况
节Hardy—Weinberg平衡检测:Genepop、SGoF+软件
第二节连锁不平衡检测:Genepop软件
第三节等位基因丰富度比较:ADZE软件
第五章遗传分化
节FST分析:Genetix软件
第二节AMOVA分析:GenAIEx软件
第六章分组分析
节Structure软件分析及CONVERT、Structure Harvester、CLUMPP软件
第二节TESS软件分析及PAST、TESS Ad—Mixer软件
第七章空间遗传结构分析
节sPCA分析
第二节Alleles in space和Surfer软件
第三节空间自相关分析:SPAGeDi软件
第四节空间遗传结构的异向性:PASSaGE软件和R程序
第八章 景观遗传学分析
节表面距离:ArcGIS软件
第二节加权线性距离、最小成本距离和阻抗距离:R程序
第三节Mantel test和Partial Mantel test: PASSaGE软件
参考文献
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