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二穗短柄草中抗病基因家族的分析及机器学习预测方法研究 谭生龙,陈利红 著 专业科技 文轩网
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二穗短柄草中抗病基因家族的分析及机器学习预测方法研究
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抗病基因对植物的生长发育起着非常重要的免疫调控作用,植物中抗病基因的数量和特征对该植物的抗病机制研究至关重要。本书选择禾本科植物二穗短柄草作为研究对象,系统鉴定了该物种内最重要的一类抗病基因家族,这类抗病基因所编码的蛋白具有核苷酸结合结构域(NBS,Nucleotide Binding Site)和亮氨酸重复结构域(LRR,Leucine-Rich Repeats),并系统分析了这些抗病基因。在获得二穗短柄草中的NBS-LRR抗病基因列表后,继续研究了其数字序列特征,并应用机器学习中的支持向量机算法对这些特征进行训练建模,构建和优化后的机器学习模型,可实现对其他已测序物种的快速抗病基因鉴定。本书可供基因分析及机器预测学习方法研究人员参考。
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