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  • 基于高通量测序的基因组分析 王峥峰 著 专业科技 文轩网
  • 新华书店正版
    • 作者: 王峥峰著
    • 出版社: 科学出版社
    • 出版时间:2022-06-01 00:00:00
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    商品参数
    • 作者: 王峥峰著
    • 出版社:科学出版社
    • 出版时间:2022-06-01 00:00:00
    • 版次:1
    • 印次:1
    • 印刷时间:2022-06-01
    • 字数:202000
    • 页数:160
    • 开本:16开
    • 装帧:平装
    • ISBN:9787030721488
    • 国别/地区:中国
    • 版权提供:科学出版社

    基于高通量测序的基因组分析

    作  者:王峥峰 著
    定  价:108
    出 版 社:科学出版社
    出版日期:2022年06月01日
    页  数:160
    装  帧:平装
    ISBN:9787030721488
    主编推荐

    内容简介

    高通量测序已成为生物学研究的重要手段,在生物多样性、物种种质资源开发利用和生物医药领域都发挥了非常重要的作用,因此,如何处理和分析高通量测序数据成为生物学研究的推荐技能之一。本书以高通量测序数据在基因组分析中的运用为例,采用分步讲解的方式,图文并茂地介绍了高通量测序数据的基本格式,利用高通量测序数据开展分析的流程、相关程序,程序执行过程及其分析注意事项。同时,对于数据分析运算中的一些中间结果,作者提供了自己编写的程序,以利于获得最终结果。书中提供了Linux操作系统安装方法,并基于Linux语言命令介绍了高通量测序数据处理过程,其中没有复杂的程序代码,不需要编程语言基础,浅显易懂,具有很强的实践操作性。本书可供基因组学、生物信息学、遗传学、生态学及相关领域的高校师生和科研人员阅读参考。

    作者简介

    精彩内容

    目录
    第一章 Linux系统安装
    第二章 Linux基本命令
    第三章 高通量测序数据的常见格式
    第四章 基因组组装
    第一节 基因组大小估测
    第二节 基于PacBio HiFi模式测序数据的基因组组装
    第三节 基于PacBio CLR模式测序数据的基因组组装
    第四节 基于Nanopore测序数据的基因组组装
    第五节 去除基因组中的冗余序列
    第六节 Hi-C组装
    第五章 重复序列查找
    第六章 基因预测
    第七章 基因家族扩张和收缩
    第八章 物种历史动态
    第九章 群体重测序个体的SNP查找
    第十章 遗传多样性参数计算
    第十一章 受选择作用的SNP位点
    第一节 PCAdapt分析
    第二节 BayPass分析
    第三节 合并PCAdapt和BayPass结果
    第十二章 遗传结构分析
    第一节 PCA分析
    第二节 Admixture分析

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